研究人员对巴森吉狗的基因组进行测序

2022-01-14 / 作者:猫咪资讯 / 来源:网络整理 / 阅读:714 /
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一个国际科学家小组已经完成了巴森吉犬(犬科动物)的基因组测序和组装,这是一种起源于中非的古老犬种,目前仍在刚果与部落成员一起生活和狩猎。Basenji的基因组位于犬种族谱的基础上,为未来犬种间的比较和犬的进化分析提供了极好的无偏参考。巴森吉狗(家犬狼疮)。大约30,000年前,狗......

一个国际科学家小组已经完成了巴森吉犬(犬科动物)的基因组测序和组装,这是一种起源于中非的古老犬种,目前仍在刚果与部落成员一起生活和狩猎。Basenji的基因组位于犬种族谱的基础上,为未来犬种间的比较和犬的进化分析提供了极好的无偏参考。

The Basenji dog (Canis lupus familiaris).巴森吉狗(家犬狼疮)。

大约30,000年前,狗是第一批被人类驯化的动物,由于广泛的人工特征选择,狗表现出异常水平的品种变异。

目前还不清楚它们是被驯化了一次还是几次,尽管越来越多的证据表明发生了多种事件。

通过为更古老的犬种建立基因组资源,科学家可以探索现代犬种独有的基因适应性。

巴森吉狗是一种古老的品种,它位于目前公认的狗家谱的基础上。

像巴森吉狗一样的狗被描绘在可追溯到埃及第12王朝的绘画和模型中,它们与贱民狗有许多共同的独特特征。

像野狗和新几内亚唱歌的狗一样,巴森吉狗每年都会发情& # 8212;与大多数其他狗品种相比,它们每年有两个或更多的繁殖季节。这三个品种在现代品种特有的树皮上容易发出嗥叫、嗥叫和其他叫声。

巴森吉犬绰号“无犬只”,最初是非洲中部的土著,那里有热带森林。主要是现在的刚果民主共和国、苏丹南部、中非共和国和大西洋中部沿海的小国。

今天,他们的领土已经缩小到中部非洲更偏远的地区。

巴森吉人可能在1843年左右首次出现在西方世界。在一幅画中,三只属于维多利亚女王和阿尔伯特王子的狗被命名为“埃斯基莫、尼日尔和海王星”,尼日尔显然是一只巴森吉狗。

新南威尔士大学生物技术和生物分子科学学院的研究员理查德·爱德华兹博士说:“这只狗可能是第一只被人类驯化的动物,随后被人类人工选择成各种不同大小和形状的狗品种。

“在这篇论文之前,很难解释狗参考基因组和非家养狗之间的差异,如野狗、豺狼、郊狼、狼和狐狸。”

“大的变化可能是最近在特定参考品种的创建过程中人工选择的结果。”

“通过在家犬家谱的基础上添加这样一个高质量的基因组,我们为研究提供了一个锚点,可以帮助确定驯化和后续育种过程中遗传变化的时间和方向。”

新南威尔士大学生物、地球和环境科学学院的研究员凯莉·凯恩斯博士说:“由于Basenjis是一个非常古老的品种,它们提供了与更现代品种的完美比较,以探索品种是如何发展的,驯化的过程,并协助寻找疾病基因的研究。

“这个基因组在与狼、野狗和乡村狗作为古代家养品种的例子进行比较时也将是至关重要的。”

研究人员对两个巴森吉人的基因组进行了测序:一个是中国女性,一个是中国男性Wags。

爱德华兹博士说:“在代表39条狗染色体的39个片段中,可以发现超过99%的最终基因组组装。

“这些染色体只有一百个区域的未解析序列,是迄今为止所有已发表的狗基因组中最少的。”

“这使它成为迄今为止生产的最高质量的狗基因组之一。”

科学家们还进行了成对比较,并分析了三种狗品种组装基因组之间的结构差异:巴森吉狗、鲍克瑟狗和德国牧羊犬。

爱德华兹博士说:“Basenji的基因组序列不同于传统的狗参考基因组CanFam,CanFam是一个高度衍生的品种,即Boxer。

“狗参考基因组的选择会影响未来观察遗传变异的狗遗传学研究的结果。”

凯恩斯博士补充说:“巴森吉的基因组可能会让科学家们更全面地揭开早期狗的进化史,以及人类是如何将第一批狗塑造成我们今天的伴侣和品种的。”。

“许多人不会意识到,大多数狗的品种是在过去200-300年间出现的。”

“因此,从巴森吉犬这样的古老品种中获得高质量的参考基因组,有助于深入了解早期品种的发展,以及在过去几千年里,穹顶抽搐犬是如何被人类塑造的。”

“我们还将能够解决关于新几内亚野狗及其亲属进化史的悬而未决的问题,巴森吉犬将充当非驯化野狗和真正现代犬种(如哈巴狗、凯尔派和贵宾犬)之间的中间点。”

研究结果于2021年3月发表在《BMC基因组学》杂志上。

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R.J. Edwards等人,2021年。原始巴森吉狗(家犬狼疮)基因组的染色体长度基因组组装和结构变异。BMC基因组学22,188;doi: 10.1186/s12864-021-07493-6


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